Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (47 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Lebeckia: root; cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; core eudicotyledons; rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; Crotalarieae; Lebeckia;
Select All
>152003720 see NCBI Nucleotide Lebeckia carnosa Method 1 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGAGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCGGTTGGTCGCCCAAGACGG
.....(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).....((((..(((((((......)))))))..)))).......(((((.((((.((..(((((.(((..((.((((..((((((....)))))).)))).)).))))))))..)))))).))))).((((((...((((........))))...)))))).........
>152003724 see NCBI Nucleotide Lebeckia sericea Method 1 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTCCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG
.....(((((((((((((.((((.....))))))))))....))))))).((((.((.....)).))))..(((....((((((.........(((((.((((.((..(((((.(((..((.((((..((((((....)))))).)))).)).))))))))..)))))).))))).))))))....))).......(((((..(((....)))))))).
>152003745 see NCBI Nucleotide Lebeckia cytisoides Method 1 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGTAACGCCTCATGGTTGGTTGAAAACTGAGTCATTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTACGGCCCATGAGCGTNTNTTGGTCGCCCAAGATCGG
.....(((((((((((((.((((.....))))))))))....)))))))..(((.((.....)).))).((((.((((((...((((......(((((.(((((((.(((.((((((..((.((((..((((((....)))))).)))).)).)))).))..))))))))))......)))))..))))))))))))))....(((((......))))).
>11120119 see NCBI Nucleotide Lebeckia sessilifolia Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTGGGCACCGAGAGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGATTCTGTGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260522 see NCBI Nucleotide Lebeckia pungens Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGGATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGTTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260523 see NCBI Nucleotide Lebeckia psiloloba Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGCTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260524 see NCBI Nucleotide Lebeckia macrantha Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGTGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGCTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.((((((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).)).))))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260526 see NCBI Nucleotide Lebeckia multiflora Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260532 see NCBI Nucleotide Lebeckia spinescens Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAATACGGGA
((((((..(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((.(..(((....)))).)))...
>169260533 see NCBI Nucleotide Lebeckia cinerea Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAAATGAGTTTGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260534 see NCBI Nucleotide Lebeckia melilotoides Method 2 (see details)
GCCTATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAGCGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTTTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>169260535 see NCBI Nucleotide Lebeckia halenbergensis Method 2 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTGTGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGA
((((((..(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))))))..)))...((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))...
>152003719 see NCBI Nucleotide Lebeckia carnosa Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGAGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG
((.(((((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).)).)).....((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....)))))))).
>152003725 see NCBI Nucleotide Lebeckia wrightii Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGAGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG
((.(((((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).)).)).....((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....)))))))).
>169260529 see NCBI Nucleotide Lebeckia halenbergensis Method 3 (see details)
TCGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTGTGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACG
(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).((((.((.....)).))))..(((..((((..(((((.....((((((.((((.((.((((((.(((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))))))).))))))).))))).))))))))))))).......(((((..(((....))))))))
>169260528 see NCBI Nucleotide Lebeckia sericea Method 3 (see details)
ACTCTCGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTCCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACG
(.(.(((((((((((((.((((.....))))))))))....)))))))..).)......((((((((...).)))))))..(((((.....((((((.(((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)..))))).))))))......(((((..(((....))))))))
>169260521 see NCBI Nucleotide Lebeckia macrantha Method 3 (see details)
ACTCTCGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGTGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGCTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACG
(...(((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).).........((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.((((((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).)).))))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))
>169260520 see NCBI Nucleotide Lebeckia pungens Method 3 (see details)
ACTCTCGCCCCAGTGCCTTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGCGGGGTGGATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAATTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGTGTCACCCCCATCGGTTTTGTGACTCTATGGCCCATGAGCGTTTGTTGGTCGCCCAAGACG
(.(.(((((((.(((((.((((.....))))))))).....)))))))..).)......((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).).).)))))))))....)).))))).))))))......(((((..(((....))))))))
>146424366 see NCBI Nucleotide Lebeckia cytisoides Method 3 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGTAACGCCTCATGGTTGGTTGAAAACTGAGTCATTGGTGGAGGGCGCCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAACTCGAGACCGATCGTGCGTGTACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTACGGCCCATGAACGTCTGTTTGTCGC
((((.(((.((((..(((((....(...)))))).)))).)))...)))).(.(..(((((..((((((((...).)))))))..)))))...).)(((((..(((.((.(.(((.(.(((.(((.((((..(((((.....))))).)))).)))))))))).))))))..))))).(((((...(((((........).))))..)))))
>169260538 see NCBI Nucleotide Lebeckia carnosa Method 3 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGAGCTAGGCACCGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCGGTTGGTCGCCCAAGACG
((.(((((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).)).)).....((((((((...).)))))))..(((((.....((((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)).))))).))))))......((((..((((....))))))))
>169260525 see NCBI Nucleotide Lebeckia sericea Method 3 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTCCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACG
((.(((((((((((((((.((((.....))))))))))....))))))).)).)).....((((((((...).)))))))..(((((.....((((((.(((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..)))))))))....)..))))).))))))......(((((..(((....))))))))
>169260530 see NCBI Nucleotide Lebeckia cytisoides Method 3 (see details)
CATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGTAACGCCTCATGGTTGGTTGAAAACTGAGTCATTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTACGGCCCATGAGCGTCTGTTTGTCGCCCAAGACG
((.(((((((((((((((.((((.....))))))))))....))))))).)).)).....((((((((...).)))))))..(((((.....((((((..((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))).))..))))))))).......))))).))))))......(((((..(.(....).))))))
>146424361 see NCBI Nucleotide Lebeckia wrightii Method 3 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGAGCTAGGCACCGACCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGC
((((.(((.((((..(((.(....(...)).))).)))).)))...)))).(.(..(((((..((((((((...).)))))))..)))))...).)(((((.((((.((.((((((.(((.(((.((((..((((((....)))))).)))).))))))))))).))))))).))))).((((((..(((((.(....).).)))).))))))
>169260536 see NCBI Nucleotide Lebeckia lotonoides Method 3 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACCGAGTGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGCTGGTTGAAAACTGAGTTCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTGCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGGGACCTCA
((.((.(((((((((.(((((.((((.....))))))))).....))))))).)).))))...(((.(((......))).)))..(((((.(....(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))).)))))..((((..((((((((...)).)..)))))..))))
>169260527 see NCBI Nucleotide Lebeckia sericea Method 1 (see details)
GCCCATCGTTGCCCCAGTGCCCTGGCCTCGCGCTAGGCACTGAGCGGGGCGAATGCTGGCTTCCCGTGAGCAACGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGTGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGTTGAGTAAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCGGCTTTCCGACTCTATGGCCCATGAGCGTCTGTTGGTCGCCCAAGACGG
(((.....(((((((((((((.((((.....))))))))))....))))))).....)))...(((((((......)))))))..(((((......(((((..((((((.(((.((((((..((.((((..((((((....)))))).)))).)).)))).))..))))))))).......)))))..)))))......(((((..(((....)))))))).
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.