Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (300 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Lupinus: root; cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; core eudicotyledons; rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; Genisteae; Lupinus;
Select All
>2230919 see NCBI Nucleotide Lupinus albus subsp. albus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAATGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTTACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((((((.(...))))))))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230925 see NCBI Nucleotide Lupinus albus var. graecus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAATGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTTACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((((((.(...))))))))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230921 see NCBI Nucleotide Lupinus albescens Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGCCCACATGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGTGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(.(.....).)))))))...).))))))))))..((((..(((((((.(...))))))))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230929 see NCBI Nucleotide Lupinus angustifolius Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGCTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230937 see NCBI Nucleotide Lupinus aschenbornii Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCCTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..(((((((((((((.((((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230957 see NCBI Nucleotide Lupinus elegans Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCCTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..(((((((((((((.((((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230939 see NCBI Nucleotide Lupinus atlanticus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCTAGACCGAACGTGCGCGTCACCCCCACCAGCTCTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.((((...).))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.((..((((..((((((....)))).))))))..)))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230941 see NCBI Nucleotide Lupinus aureonitens Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGCCCACATGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGATCGATCGTGCGAGTCACCCCCACCAGCTTTGTGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(.(.....).)))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230947 see NCBI Nucleotide Lupinus cosentinii Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCTAGACCGAACGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTCTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.((..((((..((((((....)))).))))))..)))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230951 see NCBI Nucleotide Lupinus microcarpus var. densiflorus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAGGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..(..(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230969 see NCBI Nucleotide Lupinus microcarpus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAGGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..(..(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230963 see NCBI Nucleotide Lupinus hispanicus Method 2 (see details)
CATCGTCGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGGGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGCTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230965 see NCBI Nucleotide Lupinus latifolius Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCTGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....))))))))).)...))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230967 see NCBI Nucleotide Lupinus luteus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACGAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGGGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGCTAAAGCTCGAGACCGGTCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
.....((((((((((((((.(((.....))))))))))....)))))))...((((((..(((.(((.(...)))).)))..))))))..(..(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))).)..))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230971 see NCBI Nucleotide Lupinus micranthus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGTGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATTGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATTGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
.....(((.((((((((((.(((.....))))))))).....)))))))...((((((..(((((((.(...))))))))..))))))..(..(((((((((((((.((((((((((((...((((..((((((....))))).))))))))))).))))..)).))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230945 see NCBI Nucleotide Lupinus bogotensis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAATCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230949 see NCBI Nucleotide Lupinus mutabilis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAATCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230973 see NCBI Nucleotide Lupinus mutabilis Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAATCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..(((((((.((((((.(((.....))))))))).....))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230923 see NCBI Nucleotide Lupinus albifrons Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230931 see NCBI Nucleotide Lupinus arboreus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230933 see NCBI Nucleotide Lupinus arcticus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230935 see NCBI Nucleotide Lupinus argenteus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230943 see NCBI Nucleotide Lupinus benthamii Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230961 see NCBI Nucleotide Lupinus formosus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCCAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGTCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCGAGACCGATCGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTTTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTTCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.(((.(...)))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.(((.((((..((((((....))))).))))).))))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
>2230953 see NCBI Nucleotide Lupinus digitatus Method 2 (see details)
CATCGTTGCCCCCGTGCCTTGGCCACGTGCTAGGCACCAAGCGGGGCGAATGTTGGCTTCCCGCGAGCAATGCCTCACGGTTGGTTGAAAACTGAGTCCGCGGTGGAGGGCGCCGTGATGGATGGTGGCTGAGTTAAAGCTCTAGACCGAACGTGCGTGTCACCCCCACCAGCTCTGCGACTCTTTGACCCATGGGGTCTGTTGGCCTCCTAATACGGGA
(((..((((((((((((((.(((.....)))))))))...).))))))))))..((((..(((.((((...).))).)))..))))....(..(((((((((((((.(((.((((((.((..((((..((((((....)))).))))))..)))))).))..)))))))).))...).)))))..)..(((((((((((....)))).)).).)..))).
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.