The ITS2 database

Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.

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ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (18 hits, page 1)

Lineage of Puccinia recondita: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Pucciniomycotina; Pucciniomycetes; Pucciniales; Pucciniaceae; Puccinia; Puccinia recondita;

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>300295293 Puccinia recondita Method 2 (see details) ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAAATTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATGAGGGACTTCTAAAAACCCCCCCTTTTATAAAATTTAAGA .....(.(.((.(((((((((.((((.((....)).))))).)))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))))).)))).))))))))....))))))))).)))..........(((....))).......

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>90186487 Puccinia recondita f. sp. secalis Method 2 (see details) ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTCTTTCTTTGAAAGATTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATCAGTCACTTTTCGAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTGTAATAATTTTATATCATCACATTAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTATTTAATGAAAGAGACTTCTAAAGAACCATACATTTTTTTTTACTTAAGA .......(.((.(((((((((...((((((...))))))..))))))))))).)..(((((..((((....)))).)))))....(.((..((((..((((.(((((((.(((.......((..((((..(.((((..(..(.(.(...).).)))))).)..))))).)))).))))))))....))).))))..)))...............((((.....))))

>37703613 Puccinia recondita Method 2 (see details) ATGAAACCCTCTCATTAAACATTTTCTTTCTTTGAAAGATTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATCAGTCACTTTTCAAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTTAATAATTTTATATCATCACATTAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTATTTAATGAAAGAGACTTCTAAAGAACCATACTTTTTTTACTTAAGA .....(.(.((.(((((((((...((((((...))))))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).))))).......(..((((..((((((((((((.(((.......(((((.(..(.((((..(..(.(.(...).).)))))).)..))))).)))).)))))))...))))).))))..)............(((.(......))))

>169604 Puccinia recondita Method 3 (see details) ACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAACTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATAAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTTCCAAAA (.(.((.(((((((((...(((((....)).)))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))))).)))).))))))))....))))))))).))).........((((....))))

>169620 Puccinia recondita Method 3 (see details) ACCCTCTCATTAAACATTTTTTAACTTGTTTAAACTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTCATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATAAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTTAATATAAGGGACTTCTAAAAACCCCCCTTTTTTCCAAAA (.(.((.(((((((((...(((((....)).)))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((.(((((.(((((((.(((.......((((((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))))).)))).))))))))....))))))))).))).........((((....))))

>169599 Puccinia recondita Method 3 (see details) ACCCTCTCATTAAACAATTTTGTAAAAAGAAATTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATAAGTCACTTTTCAAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTAATAATTTTATCATCACATCAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTGTTGAATGGAGACTTCTAAAAAAACCCCCCTTAACCATTTTAAG (.(.((.(((((((((.((((.......)))).))))))))))).).)(((((..((((....)))).)))))....(.((.(((((..(((((.((((((.(((.......((.(((..(.(((((..(.(.......).)))))).)..))).).)))).))))))))).)).))))).)))..........(((.........)))

>169601 Puccinia recondita Method 3 (see details) ACCCTCTCATTAAACATTTTCTTTCTTTGAAAGATTTGTTTAGTGGATGTTGAGTGTTGCTGTAATTAGCTCACTTTAAATATATCAGTCACTTTTCGAATGAGTTGGATTGACTTGGTGTGTAATAATTTTATATCATCACATTAAGGAAAGTAGCAATACTTGCCATCTTATTTAATGAAAGAGACTTCTAAAGAACCATACATTTTTTTTTACTTAAGA (.(.((.(((((((((...((((((...))))))..))))))))))).).)(((((..((((....)))).))))).......(..((((..((((((((((((.(((.......(((((..(..(.((((..(..(.(.(...).).)))))).)..))))).)))).)))))))...))))).))))..)...............(((.(......))))

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Id	Description*
1	Unafold - Direct
2	Homology modeled
3	Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

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