Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (298 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Suillus: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Boletales; Suillineae; Suillaceae; Suillus;
Select All
>6906752 see NCBI Nucleotide Suillus bovinus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACTCCTCTCGATCGACTTCGAGTGGAGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGAATATTCGTGTTCGGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCTGTTTTTGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAAACCGTGCCGTGCCTCTAATCCGTCGATGCCTCTATGGGGCGTCTTCTTTATGCATTTGA
.........((((((((.(((((......))))).)))).))))..(.((((((..(((.(((.((((((((....)))))))).))).))).))))))...).....(((..(((((.((.(((((....(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))....))))).)).))))))))...........((((((((...))))))))................
>1916677 see NCBI Nucleotide Suillus amaranthii Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAATGAACGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGATGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).).)))........
>1916679 see NCBI Nucleotide Suillus suilloides Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAATGAACGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGATGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).).)))........
>1916680 see NCBI Nucleotide Suillus suilloides Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAATGAACGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGATGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).).)))........
>1916683 see NCBI Nucleotide Suillus umbrinus Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTCGCTTCGAGGGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAATGAACGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGATGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).).)))........
>1916681 see NCBI Nucleotide Suillus sp. 'Cooke-53119' Method 2 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGACAGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAACGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTCGGGGCCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.........(((((((((.((((......)))).)))).).)))).....(((((..(((.(((.(.(((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))))).).))).)))))))))))..(((((.(..((((((....))...)))))....)))))........
>10638119 see NCBI Nucleotide Suillus sp. EP09 Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGAGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAACGAATGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGACGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATCGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((.....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..(.((.((..((((((((....))))))))...)).)).)........
>1916682 see NCBI Nucleotide Suillus tomentosus Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGAGGGTGCTTGGATAGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAACGAATGGTCTCGTGCCCCTAATCAGTCGATGTCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((......)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).))))........
>10638006 see NCBI Nucleotide Suillus fluryi Method 2 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATCTTTTTCGAGCGGGCGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAATCGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTCGGGGCGTCTTCCTTATCGACGTTTGA
.........((((((((.(((((......))))).))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((.(((.((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))).))).)))..))))))))))..((((.(((.(((((((....)))))))......)).))...))).
>10638077 see NCBI Nucleotide Suillus granulatus Method 2 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATCTTTTTCGAGCGGGCGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAATCGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTCGGGGCGTCTTCCTTATCGACGTTTGA
.........((((((((.(((((......))))).))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((.(((.((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))).))).)))..))))))))))..((((.(((.(((((((....)))))))......)).))...))).
>10638117 see NCBI Nucleotide Suillus sp. EP06 Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGAGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAACGAATGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGACGCCTTTTCGAAGGCGTCTTCCTTATTGACGTTTGA
.........((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((.....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((((((((....))))))))...)).))))........
>10637998 see NCBI Nucleotide Suillus aeruginascens Method 2 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGATAGGGTGCTTGGATACTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGACGAAAGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTTAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAATGGTTCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTTTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA
.........(((((((((.((((......)))).)))).).)))).....(((((..(((.(((.(((((((....))))))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..(((((.(..((((((.....)))))))....)))))........
>10638073 see NCBI Nucleotide Suillus granulatus Method 2 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATCTTTTTCGAGCGGGCGCTTGGATGGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGGATTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAATCGTCCCGCGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTTCGGGGCGTCTTCCTTATCGACGTTTGA
.........((((((((.(((((......))))).))).).)))).....(((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).)))))..........(((..((((..((.(((.((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..))))).))).)))..))))))))))..((((.(((.(((((((....)))))))......)).))...))).
>9295402 see NCBI Nucleotide Suillus variegatus Method 3 (see details)
TCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGAGGGAGCTTGGATCGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGTTTTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTGTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCACGAACGAATGGTCTCGTGCCTCTAATCAGTCGANGCCTTTTCGAAAGCGTCTTCCTTATTG
((((((((((((((......))))))))).).)))).....(((((..(((.(((.((((.....)))).))).))).)))))..........(((..((((..((((((((..(((((((..(..(((....((((((((....)))).)))).))))..)))))))..)))).)))))))))))..((((.((..((.((.((....)).)).))...)).))))
>10638000 see NCBI Nucleotide Suillus bovinus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACTCCTCTCGATTGACTTCGAGTGGAGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGAATATTCGTGTTCGGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCTGTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAAACCGTGCCGTGCCTCTAATCCGTCGATGCCTCTATGGGGCGTCTTCTTTACGCATTTGA
.........((((((((.(((((......))))).)))).)))).....(((((..(((.(((.((((((((....)))))))).))).))).)))))..........(((..(((((.((.(((((....(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))....))))).)).))))))))...........((((((((...))))))))................
>10638001 see NCBI Nucleotide Suillus bovinus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACTCCTCTCGATTGACTTCGAGTGGAGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGAATATTCGTGTTCGGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCTGTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAAACCGTGCCGTGCCTCTAATCCGTCGATGCCTCTATGGGGCGTCTTCTTTACGCATTTGA
.........((((((((.(((((......))))).)))).)))).....(((((..(((.(((.((((((((....)))))))).))).))).)))))..........(((..(((((.((.(((((....(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))....))))).)).))))))))...........((((((((...))))))))................
>10638002 see NCBI Nucleotide Suillus bovinus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACTCCTCTCGATTGACTTCGAGTGGAGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGAATATTCGTGTTCGGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCTGTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAAACCGTGCCGTGCCTCTAATCCGTCGATGCCTCTATGGGGCGTCTTCTTTACGCATTTGA
.........((((((((.(((((......))))).)))).)))).....(((((..(((.(((.((((((((....)))))))).))).))).)))))..........(((..(((((.((.(((((....(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))....))))).)).))))))))...........((((((((...))))))))................
>10638004 see NCBI Nucleotide Suillus bovinus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACTCCTCTCGATTGACTTCGAGTGGAGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGACCTGAATATTCGTGTTCGGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGTATTGGCTTGCGGTCTGTTTTCGACTTTGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCCGAAGTGCATGAATGAAACCGTGCCGTGCCTCTAATCCGTCGATGCCTCTATGGGGCGTCTTCTTTACGCATTTGA
.........((((((((.(((((......))))).)))).)))).....(((((..(((.(((.((((((((....)))))))).))).))).)))))..........(((..(((((.((.(((((....(((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))....))))).)).))))))))...........((((((((...))))))))................
>10638075 see NCBI Nucleotide Suillus granulatus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGAGGGCGCTTGGATGGTGGAGGCTGCCGGAGACCTGGATTCGTTCAGGACTCGGGCTCCTCTGAAATGAATCGGCTTGCGGTCGACCTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCACGACAGAAAACGGTCCCGCGCCTCTAATGCGTCGACGCCTTCCGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.........((((.(((((((((......)))))))))...))))..(.((((((..(((.(((.((((((....)))))).))).))).))))))...).....(((..((((..(((((((.....(((((.....(((...(((((..........)))))...)))...))))).....)))...)))))))))))......((((((((((((...))))))).........)))))....
>10638078 see NCBI Nucleotide Suillus luteus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGACTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.....((((...((((..(((((......))))).))))....))))...(((((..(((.(((...(((((....)))))..))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((...(((((..........)))))...)))...)))))))...))).)))))))))))......((((((((((((....))))))).........)))))....
>10638079 see NCBI Nucleotide Suillus luteus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.....((((...((((..(((((......))))).))))....))))...(((((..(((.(((...(((((....)))))..))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((...(((((..........)))))...)))...)))))))...))).)))))))))))......((((((((((((....))))))).........)))))....
>10638080 see NCBI Nucleotide Suillus luteus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGATTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.....((((...((((..(((((......))))).))))....))))...(((((..(((.(((...(((((....)))))..))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((...(((((..........)))))...)))...)))))))...))).)))))))))))......((((((((((((....))))))).........)))))....
>10638121 see NCBI Nucleotide Suillus luteus Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAGCGGGTGCTTGGATGTTGGGGGCTGCCGGAGACACTGGACTCGTCCAGGACTCGGGCTCCTCTTAAATGAATCGGCTCGCGGTCGACTTTCGACTTTGCATGACAAGGCCTTTGGCGTGATAATGATCGCCGTTCGCCGAAGTGCAAGACAGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGCGTCGACGCCTCTAGGGGCGTCTTCCTCATTGACGTTTGA
.....((((...((((..(((((......))))).))))....))))...(((((..(((.(((...(((((....)))))..))).))).)))))..........(((..((((..(((((((...(((((((.....(((...(((((..........)))))...)))...)))))))...))).)))))))))))......((((((((((((....))))))).........)))))....
>176060 see NCBI Nucleotide Suillus spraguei Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTACTTCGAGCGGGCGCTTGGATATTGGGGGCTTGCCAGAGACCTTCATGGACTCGGGCTCCCCTTAAATGCATCGGCTTGCGGTCGACTTTCGACTTTGCGCGACAAGGCCTTCGGCGTGATAATGATCGCCGTCGACCGAAGCGCATGAATGAACCCGTCCCGCGCCTCTAATCCGTCGACGCCTTTTGGCGTCTTCCTCTTTGACGTTTGA
.........((((.(((.(((((......))))).)))...)))).....(((((...(((.(((.((.....)).))).))).)))))..........(((..((((..(((.((((....(((((.....((...((((((((((....)))).))))))))...)))))....))))...)))))))))).......((((((((((....)))))).........)))).....
>176063 see NCBI Nucleotide Suillus grevillei Method 1 (see details)
AGTAAATTCTCAACCCCTCTCGATTTGCTTCGAAAGGGTGCTTGGATAGTGGGGGCTGCCGGAGATCTGGACTTCTCGTCTAGGACTCGGGCTCTCCTGAAATGAATGGGCCTGCGGTCGACTTTCGACTATGCATGACAAGGCTTTTGGCGTGATAATGATCGCCGCTCGCTGAAGTGCATGAATGAATGGTCCCGTGCCTCTAATGTGTCGATGCCTTCTGGCGTCTTCCTTATTGACTTTTGA
.........((((.((((.((((......)))).))))...)))).....(((((..(((.(((.(((((((.....))))))).))).))).))))).........((((..((((..((((((((..(((((((.....(((....((((((((....)))).)))).)))...)))))))..)))).)))))))))))).(((((....((((((....)))))).....)))))........
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.