Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
   
Predict
   
Model
   
Annotate
   
Motif
   
Tools
 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications

ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (41 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of uncultured Clavulina: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Cantharellales; Clavulinaceae; environmental samples; uncultured Clavulina;
Select All
>116876118 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGGCTTTGTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTACAGATTCTTCAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.(((((.(((...)))))))).....))).)))).((.(..((.(...(((((.(((.......)))))))).).))).)).......(.(......(((.(.(..(.((.((....((((((((((....))).)..)))))))).)))).).)))).)............((((((.....)))))).............................................
>238805209 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA
........(((((((..((.(((.((...)...)))).)))).))))).(.(.((.(...((((((((.......)))))))).).))..).)......(((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..))...))).))))).......((.(((...).)).)).............................................
>269930234 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGTACGGCTGGTCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCGTTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGCTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.((((((.(.......).))))))..))).)))).(..(((.(...((((((((..(...))))))))).).))..)).......(.(......(((.(.(..(.((.((....((((((((((....))).)..)))))))).)))).).)))).)...........(((((((.....)))))))...............................................
>304272893 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTATGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAATGCATTAGCTGATCCTTGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTCGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTGTTGCAAGTTATTTCAATCTGTAATGCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.((..((((.....)...))))).))).)))).....((.(...(((((.((...(...)))))))).).))............((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..).)..))).))))........(((((..(...))))))..............................................
>306846738 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ATTAAATTCTCAACTTCAAATTGAATTTTGAAGCTTGGACTTTGGAGGTTTGCTGGTGTCACTATCAGCTCCTCTTAAATTCATTAGCGGAACTGTAAGGACCGGCTTTGGTTTGATAGCTAACATTATCTATGCCGTTGCTGTGACCTTTGTGTTTGGCTTCTAATGGTCATTTTGTTGACTGTCTCTGCTTTGAGGCATACACTTTTAAGCTTGA
.........((((((((((((...)))).)))).)))).....((.((...(((((((....))))))))).))...........((((..(.(((((((.((((.(.((((.((((((.(...)))))).).))))..)))).).).))))))))..)))......((((((...).)))))..................................
>31074219 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GAAACTCTCAAACAAAGTAGATTCGTTTCTACCTCTGTTTGGATTTGGACTCTGCTGCGTCAATGCGGCTGGTCTTAAATATATTAGCTGATCCTAGCGAAGGTTTGGTTCTACTCAGCATGATAATTATCTGATGTTGAGGACAGTCTTAGGACTGGCCAGGCTCTCTATGGATTGCTTCCAATCGTCTTTGGACAATCATTCAATATCTGA
.......(((((((.((((((......))))).).)))))))....(((((..((((((....)))))).)))))...........((((.((((....((((.(((..(.(.((((((((..(((...).))))))))))))))))))))))).)))).............(((((.(.(.((.....)).)).))))).............
>222350171 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGCCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATTGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((.((..((((.....)...))))).))).)))).....((.(...(((((.(((......)))))))).).))............((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..).)..))).))))........(....(.(....).)).............................................
>253326976 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGGTGGCTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTTTTGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCCTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((..((.(((.......))).))))).)))).....((.(...((((.....((((....)))))))).).))...........(((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..).))..)).))))).......((.(((....))).)).............................................
>148612679 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGCCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
..........(((((((..(((((((.....))).))))..))).)))).....((.(...((..((((((.....)))))))).).))...........(((((....((((.((..(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))....)))..))).)))))(((....)))..........................................................
>189306935 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGNATTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGCACGGNTGGNCTTAAAAGCATTANCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGANGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATTTGNGTTCCACATNTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.((((((((.(.(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.((((((((..((...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............
>225032891 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))..............
>229892678 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTGTTCAATCTGTGGCTCCACTTTTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((.....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))..)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))..............
>204306505 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGCGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
(((((..(((((.(((.((((((((.....(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((..((((.((.((((((((..((...)))..)))))).)))..))))))))).(((...((((((.((((...(.(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).))).........(((...((((((.(.....)))))).)..)))..............
>224459493 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GCGAAATTCTTCAAGCCTTGGATGGATTTTTTTGTCTGTCCTTGGGCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCCGATCCTCGTGTGGTACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGTTGAGGACATCTTCTGGGATGGCCAGTCATCATTTGGGTTGCTTCTAAACCGGTTTCGCAGATTGCTCAATCTGTGTGCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((.((((((((((...(...))))))).).)))))))).....))).))))..(((((...(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.(((((....(.(((.(((((.((((....)))).)).))).)))).))))))))))).)))........((..(((((((.(.....))))))).)))...............
>291337370 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTTTGGATGGCTTCTTTTGTCTGTCCCTTAGCATTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTCGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAACCTGGTTTTGCAGATGCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTTTCAGCTTTGA
(((((..(((((((...(((((((((....(...).))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.((((((((((....))))).)).))).))))).)))))))))).))).......(((...((((((((...)).))))))..)))................
>291337427 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTGTCAAGCTTTGATGCTTTTTCCTGTCAAAAAGGCCCTCTCAGCTTGGTTGTTGGGCTCTGCCGTGCTCTTTATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGTATTAGCTTGATCCTCTTGGGTAAATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTCTGTGACCGCTGAGGACATCTTCCGAGATGGCCAATTCTCGATTGGGTTGCTTCTAATCTGGCTCTACGGATTTACGAATCCGTGCCGCTTCTGATTTTTTGG
.........((((((.(.((.(((((((..(...))))))).).))..))))))).....(((((..(((((.((.......)).))))).)))))..........((.(.(.((......((((((((((((((.(((((((((((....))).....)..))))))).)........)....)))))))).).).)))).).)))........(.((....)).)...............................
>291337483 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTTTGGATGGCTTCTTTTGTCTGTCCCTTAGCATTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCATGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAATCTGATCGCTGAGGACATCTTTTCGGGATGGCCGGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAACCTGGTTTTGCAGATGCTTCAATCTGTGTTCCACTTTTTTCAGCTTTGA
(((((..(((((((...(((((((((....(...).))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.((((((((((....))))).)).))).))))).)))))))))).))).......(((...((((((((...)).))))))..)))................
>157086827 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>157086829 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCTGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>157086828 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
ACGAAATTTGTCAAGCTTGGATGGCCTTTTTTGTCTGTCCATTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTATCCTTTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGCGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATACATCTGATCGCCGAGGACATCTTTCAGGATGGCCAGTCCTCGTTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGCGTTCCACTTTTCAGCTTTGA
.((((..((((((((((.((((((.(......).)))))..).)).)))))).....)).))))..((.((...(.(.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..).).)).)).(((...((((((.((((......(.(((.((((((.(((....)))).)).))).))))..)))))))))).))).........((...((((((.(.....)))))))..))...............
>148612667 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAAACCGGGATGCTTTTTTGTTTCTCGGCTTGGTGTTGGGCTTTTGCAGTTCCTTTGATTGGGATGGCTGGCCTCAAAAGCATTAGCTGGCTTTTCATGTGGCATTGGTTCTACTCAGCGTGATAATGATCTGACCGCCGAGGACATCTTTCGAGATGGCCAATTCTCATTTGGGCTGCTCCTAATTTTGGTCGAACGGATTCTGAATCTGTTCCACTTTTCAGCTTTTGA
((((((.((((((.((((((.(...(...).))))))).)))).....)).)))))).((.((...(((.((.(((((((((.(...).))..))))))..)))..)).))).)).(((...((((((.((((....(((.((.((((((.(((....))))).).))).))))).))))))))).))))........(((...((((((.(....))))))))))...............
>189306934 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 3 (see details)
GTGAAATTTCTCAAAGCTTGGATGGCCTTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTGTATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAACATTAGCTGATCCTTGTGCGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACGTCTTTTGGGATGGCCAGTGCTCATTTGGGTTGCTTATAGACCTGGTCTTGCAGATTCTTCAATCTGTGGTTCCA
(((((..(((((.(((.((((((((.....(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((..((((.((.((((((((..((...)))..)))))).)))..))))))))).(((...((((((.((((...(.(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))).)..)))
>299480141 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 3 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTTGGATGGCTTTGTTGTCTGTCCTCAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGNGTCCTTCATNTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGNTTNTAAANCCTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTCCA
(((((..((((((((..((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(.(((...(((..((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))).).(.(...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).).).........(((...((((((.(.....))))))).)))
>298162495 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 3 (see details)
CGAAATTCTTCAAGCCTTGGATGGATTTTTTTTGTCTGTCCTTGGGCTTGGTTGTTGGGCTCTGCCGTGTCCTTCATTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCCGATCCTCGTGTGGTACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAATCTGATCGTTGAGGACATCTTCTGGATGGCCAGTCATCATTTGGGTTGCTTCTAAACCGGTTTCGCAGATTGCTCAATCTGTGTGCC
((.(..((((((((.((((((((((....(...))))))).).)))))))).....))).).))..(((((...(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.(((((....(.(((.(((((.((((....)))))).))).)))).))))))))))).)))........((..(((((((.(.....))))))).)))
>190682974 see NCBI Nucleotide uncultured Clavulina Method 3 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCCAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCA
(((((..((((((((.((((((((...(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))
Select All

Show entries per page      Next >>


Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.