Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (1744 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Glomerella: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; saccharomyceta; Pezizomycotina; leotiomyceta; sordariomyceta; Sordariomycetes; Hypocreomycetidae; Hypocreomycetidae incertae sedis; Glomerellaceae; Glomerella;
Select All
>2567 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>2568 see NCBI Nucleotide Glomerella graminicola Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCCTCGCTTGGTGTTGGGGCACTACGGTTGACGTAGGCCCTTAAAAGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATCGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAACTTTTAACTGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))..........((((((.((((((.(((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))....))))))..........(((((.......))))).
>2570 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>2569 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTGAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACCGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTCTTTACAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.((((((((((((((.(((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..).)))))))...)))...(((((..(...)))))).
>6650331 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCCGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).).....
>9716376 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.((((((((((((((.(((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(.(((((.....)))))).
>2594 see NCBI Nucleotide Glomerella lindemuthiana Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCCCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTCGACGTAGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAAACTTTTACAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))(((((.((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((((...).)).)..))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(..(((((....)))))).
>2573 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTCTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((((.(...).))))).
>6650275 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACAGG
....(((...((((((...))))))..)))(((((.((((.....)))))))))...........((((((((((((.(((...((((.((((.(((.....)).)..))))..)))))))))))))..))).)))((((((.....(...)))))))...
>6650329 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTTACTAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((.(((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))))...)))..(((..(((.....)))))).
>1405843 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
AACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG
(((..((((((...)))))).)))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).).....
>1405845 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
AACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG
(((..((((((...)))))).)))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).).....
>1405847 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 2 (see details)
AACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGCCCTACACGGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGG
.....((((((...))))))..(((((..((..(((.....))).))..))))).(((.((((((((((((((.(((...((((.((((.((.(....).).)..))))..)))))))))))))..).)))))))...)))......((((...))))
>9716375 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 2 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTCTTTACAGGTTGA
....(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....))))))))).....(((((((((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).))))))..)))..(((.((......)).))).
>483628 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 3 (see details)
CAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCACACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATTCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAAATTTTTT
(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).)
>483629 see NCBI Nucleotide Glomerella acutata Method 3 (see details)
CAACCCTCAAGCACCGCTTGGTTTTGGGGCCCCACGGCCGACGTGGGCCCTTAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTTAAACCCCCAAATTTTTT
(((...((((((...))))))..)))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((....))))))))..)))))))))))))..))).)))(..(((........)))..)
>483683 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 3 (see details)
CAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCC
((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....)))))))))...........(((((((((((.((((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))..))).)))(.((((........)))).)
>9716374 see NCBI Nucleotide Colletotrichum gloeosporioides Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((((((...))))))).
>3089562 see NCBI Nucleotide Glomerella graminicola Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACGGTTGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTAACGTCTCGCATCGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTTCAATGGTT
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..((.....))....))))..)))))))))))))....))))))....)))..(((.........)))..
>2596 see NCBI Nucleotide Glomerella lindemuthiana Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGCGTTGGGGCTTCCACGGCTGACGTGGGCCCTCAAAGACAGTGGCGGACCCTCGCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATACCACCTCGCACCGGGACCCGCAGGGCACTCCTGCCGTAAACCCCCCCAATTTTAACAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((..(((((.....)))))))))..........(((((((((((.((((....((((.((((..((........))..))))..)))).))))))))...))).))))..........(((((((...))))))).
>2597 see NCBI Nucleotide Glomerella lindemuthiana Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGCGTTGGGGCTTCCACGGCTGACGTGGGCCCTCAAAGACAGTGGCGGACCCTCGCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATACCACCTCGCACCGGGACCCGCAGGGCACTCCTGCCGTNNAACCCCCCAATTTTAACAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((..(((((.....)))))))))..........(((((((((((.((((....((((.((((..((........))..))))..)))).))))))))...))).))))..........(((((((...))))))).
>2593 see NCBI Nucleotide Glomerella lindemuthiana Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCACCGCTTGGCGTTGGGGCTTCCACGGCTGACGTGGGCCCTCAAAGACAGTGGCGGACCCTCGCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATACCACCTCGCACCGGGACCCGCAGGGCACTCCTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTAACAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((..(((((.....)))))))))..........(((((((((((.((((....((((.((((..((........))..))))..)))).))))))))...))).))))..........(((((((...))))))).
>2574 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..((((((.((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
>2572 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCCCTACAGCTGATGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACTTTACGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGCACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
..........((((((...))))))..((((((.((((((.....)))))).)))))).(((..(((((((((((((.(((...((((.((((..(((....)))....))))..)))))))))))))...)).)))))....)))...(((((((...))))))).
>2571 see NCBI Nucleotide Glomerella cingulata Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTGTTGGGGCTCTACGGTCGACGTAGGCCCTCAAAGGTAGTGGCGGACCCTCCCGGAGCCTCCTTTGCGTAGTAACATTTCGTCTCGCACTGGGATCCGGAGGGACTCTTGCCGTAAAACCCCCCAATTTTCCAAAGGTTGA
....((((..((((((...)))))).))))((((.(((((.....))))))))).....(((..((((((.((((((.(((...((((.((((.((..((.....))))))))..)))))))))))))....))))))....)))...(((((((...))))))).
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.