Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (2189 hits, page 1)

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Lineage of environmental samples: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Ascomycota; environmental samples;
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>8101494 see NCBI Nucleotide uncultured ascomycete from Acaulospora colossica spore IVA.13 Method 1 (see details)
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>11118820 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq46 Method 2 (see details)
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>11118821 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq66 Method 2 (see details)
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>11118822 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq53 Method 2 (see details)
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>11118840 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra14424 Method 2 (see details)
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>11118856 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra15222 Method 2 (see details)
ATTGTAATCTCACTACCATCGACTTTTGGTCTTTCGGCATGTGGACTTGGATGTTGCCGTGAATATCTACGGCTTGTCTGAAATGCCTGAGTGTACCCCGCTTTGCGGCGTATTCGGTGTGATACATCTTCACCGGAGTTGATCCTTTGCGGTCGCGTCTGTAATGGTGTGGCTCTATGCTTCCAACCGTCTACCCTATAGACAATCTCTGACAATTT
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>10998474 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1041.3 Method 2 (see details)
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>8101483 see NCBI Nucleotide uncultured ascomycete from Acaulospora colossica spore IVB.3-2 Method 2 (see details)
ATTTAACTCTTCAAGCTTTGCTTGGTGTTGGGTATTGTTCGCCTTATGAACTTGCCTTGAATAAATTGGCAGCCAACCATTGGGTGTTGGCGCGCAGCACATTTTGCGTTCTTGACCTTAGTAGCTGGCGTCCAGAAAGCTTATTTCAACGTTT
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>10998475 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1522.5 Method 2 (see details)
ATCTAAACCCTCAAGCACTGCTTGGTGTTGGGCGCTTGTCCCGCCTCGGGCGCGGACTCGCCTCAAAAGCATTGGCGGCCTGTGTAATTGGCTTCGAGCGCAGCAGACTCGCGCCTCGCAAACCACTGGCACGGGCGTCCATCAAGACAACCCCCCCAAGTTTGA
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>10197613 see NCBI Nucleotide uncultured Greenland glacial ice fungus IM1945-1(2) Method 3 (see details)
CNNGACCCGTTCGCGGGACCTGGCGTTGGGGATCANCCTGCCCCTGGCGGCGGCTGGCCCTGAAATCCACTGGCGGTTCCCAACTCCTCCGTGCAGTAATTAAACCTCNCGCGGCAGGATAACGGTTGAACCAACTTCGACCCCGTTAAACCCCCCACTNCTCAAGGTT
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>16660300 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF04 Method 3 (see details)
GTAATGTGAATTGCANAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCCCTGGCATTCCGGGGGGCATGCCTGTTCGAGCGTCATTACACCAATCACGCACTGCGTGGTATTGGATTGAC
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>870851 see NCBI Nucleotide iceman fungal clone T2709 Method 1 (see details)
ATAATGACCAAATCACCCCCGTGGTGGACTTGGAGTTGGCTGTACTAGCCTCTCTTAAAATCAGTGGCGGTGCTCTTAAAGCTCTACGCGTAGTAATTTTCTCGCTACAGGGTCTTGATTGTACTTGCCAACAACCCCAACTTATCATAAGGTTGA
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>10197616 see NCBI Nucleotide uncultured Greenland glacial ice fungus IM124 Method 1 (see details)
ATTTCAACCCTCAGGACCCGTTCGCGGGACCTGGCNTTGGGGATCAGCCTGCCCCTGGCGGCGGCTGGCCCTGAAATCCANTGGCGGTTCCCTCGCAAATCCTCCGTGCAGTAATTAAACCTCTCGCGGCAGGATAGCGGTTGAACCACGCCGTTAACCCCCCACTTCTCAAGGTTGA
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>10998472 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1542.5 Method 1 (see details)
ATTTAGTCCACTTAAGCCTTTTGCTTAGTATTGGGAATCTACTTTTACCTTGGTAGCTGTAGTTCCTCAAAGACAGCGGCGGAGTCGTGGTTTTACTCTGAGCTTAGTAATTTTTTTCTAGCTTTCGAGTCGCCACTGCCCCCTTGCCGTAAAACACCCTTTATTTTTTAATGGTTGA
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>10998473 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCTRA 1542.2 Method 1 (see details)
ATTTAGTCCACTTAAGCCTTTTGCTTAGTATTGGGAATCTACTTTTACCTTGGTAGCTGTAGTTCCTCAAAGACAGCGGCGGAGTCGTGGTTTTACTCTGAGCTTAGTAATTTTTTTCTAGCTTTCGAGTCGCCACTGCCCCCTTGCCGTAAAACACCCTTTATTTTTTAATGGTTGA
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>11118815 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtra1011.13 Method 1 (see details)
ATTACAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTAGGCCTTACCTGCTACAGGCAGGCCGTAAAATCAGTGGCGGTGCCTTTCGGCTTCAAGCGTAGTAATTCTTCTCGCTTCGGAGTACCGGTTGCGTGCCTGCTATAAAACCCCAATTTTGTCAAAGGTTGA
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>11118819 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq62 Method 1 (see details)
ATTTCACCACTCAAGCCTCGCTTGGTATTGGGCAACGCGGTCCGCCGCGTGCCTCAAATCGTCCGGCTGGGTCTTCTGTCCCCTAAGCGTTGTGGAAACTATTCGCTAAAGGGTGTTCGGGAGGCTACGCCGTAAAACAACCCCATTTCTAAGGTT
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>11118832 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq67 Method 1 (see details)
ATTACAACCCTCAAGCTCTGCTTGGTATTAGGCCTTACCTGCTACAGGCAGGCCGTAAAATCAGTGGCGGTGCCATTCGGCTTCAAGCGTAGTAAATTTTCTCGCTTCGGAGTACCGGTTGCGTACCTGCTATAAAACCCCAATTTTTTATAAAGGTT
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>11118844 see NCBI Nucleotide salal root associated fungus UBCtraSeq68 Method 1 (see details)
ATTGCAACCCTCAAGCACTGCTTGGTGTTGGGCGGTACCGCGCGCGGTACGCCTCAAACTCAGTGGCGGCGCCACCCGGCTTCAAGCGTAGTAGCACTTCTCGCTTCGGACGCCGGGCGCGCTCCCGCCAGCAAGCCTCACTTCTCAAGGTT
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>16660298 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF01 Method 1 (see details)
ATTTGTAATCTCAAGCTATGCTTGGTGTTGGGCACTTGTCTCAGTCAAGCCTGCAGACATGCCTTAAATACATTGGCAGCCAGTATTTTGGTTTGAAATGTGCAGCACAGCGCCTCAAGCTATTTAATACAGGCAACCATGAAGATTTATCACTCTTTTGA
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>16660301 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF05 Method 1 (see details)
ATTTGTAATCTCAAGCTATGCTTGGTGTTGGGTACTTGTCTTAGTTAAGCCTAAAGACTTGCCTTAAATATATTGGCAGCCAGTATTTTGGTTTGAATGTGCAGCACAGCGCCTCAAGTTATTAAATACAGGCAACCATAAGAAATTATCACTCTTTT
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>16660302 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF06 Method 1 (see details)
ATTACACCAATCACGCCTGGCGTGGTATTGGGCGACGGGGCCGTCACACGCCCCGCGCCCCAATGACTCCCCGGCGGGACGGACCGTATCTCAGCGTTGTGCAAACTGCCGCTGGCGAGACGGGCTCGGCCGTGCCGTGAAAACCTCAATTTTATTCAGGTTGA
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>16660304 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF11 Method 1 (see details)
ATTTGTAATCTCAAGCTATGCTTGGTGTTGGGCACTTGTCTCAGTCAAGCCTGCAGACATGCCTTAAATACATTGGCAGCCAGTATTTTGGTTTGAAATGTGCAGCACAGCGCCTCAAGCTATTTAATACAGGCAACCATGAAGATTTATCACTCTTTTGA
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>16660305 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF12 Method 1 (see details)
ATTTGTAATCTCAAGCTATGCTTGGTGTTGGGCACTTGTCTCAGTCAAGCCTGCAGACATGCCTTAAATACATTGGCAGCCAGTATTTTGGTTTGAAATGTGCAGCACAGCGCCTCAAGCTATTTAATACAGGCAACCATGAAGATTTATCACTCTTTTGA
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>16660306 see NCBI Nucleotide uncultured marine ascomycete LIF14 Method 1 (see details)
ATTACACCAATCACGCCTGGCGTGGTATTGGGCGACGGGGCCGTCACACGCCCCGCGCCCCAATGACTCCCCGGCGGGACGGACCGTATCTCAGCGTTGTGCAAATGCCGCTGGCGAGACGGGCTCGGCCGTGCCGTGAAAACCTCTTTTTATTCAGGTTGA
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Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.