Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (4451 hits, page 1)

Show entries per page      Next >>

Lineage of Russulales: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Russulales;
Select All
>3688158 see NCBI Nucleotide Bjerkandera fumosa Method 1 (see details)
ATGGAATTCTCAACCTTCGACTTTGTTGTCGGAGGCTTGGACTTGGAGGTCGTGTCGGCTCTCGTAGTCGACTCCTCTGAAATGCATTAGTGCGAACGTTACCAGCCGCTTCAGCGTGATAATTATCTGCGTTGCTGTGGAGGGTATGCTAGTGTTCGCGCTTCTAACCGTCTTCGGACAACATTTCTAAACTCTGA
.........((((((((((((......)))))))).))))..(((((((....(((((((.....))))))).)))))))........((((((((((.((((..((((..(((((((((....))).))))))..))))..))))......)))))))))).......(((....)))..................
>397928 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTTGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACGCCGCGATTGTGGGGGACCCGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>1225975 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((((((((....)...))))))).))).))))....(((((....((((((.((...)))))))).)))))..........((((.(.((((((((((((.((((.(((((((..(....).))))))).)).).)..)).))...)))))))).).))))........((((.(((.....))).)))).......
>1225976 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((((((((....)...))))))).))).))))....(((((....((((((.((...)))))))).)))))..........((((.(.((((((((((((.((((.(((((((..(....).))))))).)).).)..)).))...)))))))).).))))........((((.(((.....))).)))).......
>397931 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((((((((....)...))))))).))).))))....(((((....((((((.((...)))))))).)))))..........((((.(.((((((((((((.((((.(((((((..(....).))))))).)).).)..)).))...)))))))).).))))........((((.(((.....))).)))).......
>397932 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTACGCCACGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((((((((....)...))))))).))).))))....(((((....((((((.((...)))))))).)))))..........((((.(.((((((((((((.((((.(((((((..(....).))))))).)).).)..)).))...)))))))).).))))........((((.(((.....))).)))).......
>1225971 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCTGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((((....))).)))))).)))))))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))....)...).)).......
>397926 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCTGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((.(((((.(((((((((....))).)))))).)))))))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))....)...).)).......
>1225973 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))....)...).)).......
>3688157 see NCBI Nucleotide Bjerkandera adusta Method 2 (see details)
ATGGAATTCTCAACCTTCGGCTTCATTGACGAAGCTTGGACTTGGAGGTCGTGCCGGCTCTCGTAGTCGGCTCCTCTGAAATGCATTAGTGCGAACGTTACCAACCGCTTCAGCGTGATAATTATCTGCGTTGCTGTGGAGGGTATTCTAGTGTTCACGCTTCTAACCGTCTTCGGACAAATTTCTGAACTCTGA
.........(((((.((((.(......).))))).))))..(((((((..(.(((((((.....)))))))))))))))...(((((((.....(.(.((((..((((..(((((((((....))).))))))..))))..)))))))))))))......((..((..(..((((((.(...))))))))).)))
>1225972 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>1225974 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>397927 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>397929 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>397930 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGCGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGTACACCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTCATCGAAACTTGA
.........((((((.(((((((((.(...))))).))))))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((.(((((((((....))).)))))).)))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>397933 see NCBI Nucleotide Heterobasidion araucariae Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCTGTGCTTTTCTTGTGAAAGTGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGCTTTGCTGGTCCCTCGTGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGTGAACCCTTGTGGTGCCGCCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGTGGTGCGCCGCGATTGTGGGGGGACCCGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((..(((((.(...))))).))).))).))))..(.(((((....(((((((..(...)))))))).))))).)........((((.(..(((((((((((.(((((.(((((((((....))).)))))).)..))))))))))))......)))..).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>4539773 see NCBI Nucleotide Peniophora pseudo-pini Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACTCTTCACCTTTTTCGAAGGGTGTTGGGCTGGGATTTGGGAGCATGCGGGTCCCTGGCTGATCCGCTCTCCTTGAATGCATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTTGTGTGATAATCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACATGAGGGAATCGCTTACAGCCGTCTCGCAAGAGACATTGACTCCAAC
.........(((((((..(((((((....)))))))..))).)))).((.(((((.(.((((((((...)..))))))))))))).))..((.(((((((..(((((((((((...(((((((....))).))))...))))..))))......)))..))))).).))).(((((....)))))............
>4539775 see NCBI Nucleotide Peniophora rufa Method 2 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCCCTACCTTTTTCGAAGGGTACCGGGCTGGGAATTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGTCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACCCACGGACATCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTACCAAC
.........(((((((..(((((((....)))))))..))).))))..(.(((((...((((((((...)..))))))).))))).)........(((((.(.((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......)).).))))).......(((((....))))).............
>633200 see NCBI Nucleotide Heterobasidion annosum Method 2 (see details)
GTGAAATTCTCAACCCCGTGCTTTTCTTGTGAAAGCGCGTGGGCTTGGACTTGGAGGTTTTGCTGGTCCTCGCGGATCGGCTCCTCTCAAATGCATTAGCGAGACCCTTGTGGTGCCGTCCCCGGTGTGATAATTGTCTACGCCGTGGGGTACGCCGCGATTGTGGGGGACCTGCTTCCAACCGTCGAAAGACAACTTTATCGAAACTTGA
.........(((((((((..(((((.(...))))).))).))).))))..(.(((((....(((((((.(...)))))))).))))).)........((((.(.(((((((((((..((((((((((((((....))).)))))).))))).))))))))....)))...).))))((.((..(((....)))...)...).)).......
>4539776 see NCBI Nucleotide Peniophora aurantiaca Method 1 (see details)
GTGAACTCTTCCACCCTCTACCTTTTTCGAAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAATCAATGGGGAATTGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAACGACTTAAC
........((((((((....(((((....)))))....))).)))))...(((((..(((((((.......))))))).)))))..........(((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......))))..))))).......(((((....)))))...........
>4539777 see NCBI Nucleotide Peniophora cinerea Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCCACCTTTTTCGAAAGGCGTTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACATACGGGAATCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTTCAAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539778 see NCBI Nucleotide Peniophora duplex Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCCACCTTTTTCGAAGGGTATTGGGCTGGGATTTGGGAGCATGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATGCATTAGCGAAGCCCTTTGCGGCCTTGGTGTGATAATCATCTACGCCTCGGTTTAGCAAACTTACGGGAATCGCTACCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTTCAAAC
.........(((((((...((((((....))))))...))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).))......((((((..((((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))).....)))..))))))......(((((....))))).............
>4539779 see NCBI Nucleotide Peniophora pithya Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCTATCTTTTTCGGAAGGCATTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGTGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATACGGGGACTCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTTCAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))).......))))..))))).......(((((....)))))............
>4539772 see NCBI Nucleotide Peniophora nuda Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCCACCTTTTTCGAAAGGCGTTGGGCTGGGATTTGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGTTTAGCGAACATACGGGAATCGCTTCCAACCGTCTCGCAAGAGACAATCACTTCAAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).)))).((.(((((...(((((((.......))))))).))))).)).......(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......)))..))))).......(((((....))))).............
>4539774 see NCBI Nucleotide Peniophora piceae Method 1 (see details)
GTGAACTCCTCCACCCTCCACCTTTTTCGGAAGGCGTTGGGCTGGGACCCGGGAGCTTGCGGGTCCCTGGCCGATCCGCTCTCCTTGAATACATTAGCGAAGCCCTTGCGGCCTTGGTGTGATAGTCATCTACGCCTCGGCTTAGCGAACATATGGGAATCGCTTCCAACCGTCTCGCGAGAGACAACTACTACGAAC
.........(((((((....(((((....)))))....))).))))....(((((...(((((((.......))))))).)))))..........(((((..(((((((((((..((((((((....))).)))))..))))..))))......)))..))))).......(((((....))))).............
Select All

Show entries per page      Next >>

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.