Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
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(Keller et al. 2010)


Chlorophyta hypertree

(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (97186 hits, page 1)

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Lineage of Spermatophyta: root; cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta;
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>18366 see NCBI Nucleotide Daucus carota Method 2 (see details)
ACGCATCGTGTTGCCCCTGACCAAACATCTCCTCGAGAGATTTATTTGTTCAGGGGCGGAAATTGGCCTCCCGTGCCTTTTGTGTGCGGTTGGCTCAAAAATGAGTCTCTGGTGACGGGCATCACGACATCGGTGGTTGTAAGAAGACCTTCTTGTGTCGTTGTGTATACCCGCCGCAGTAGGGAACTCGAGGGCCCTTGGGCACAGCAAAAATTGTGTGCACTTCGATTGT
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>19153 see NCBI Nucleotide Solanum lycopersicum Method 2 (see details)
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>19550 see NCBI Nucleotide Mimulus glaucescens Method 2 (see details)
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>19718 see NCBI Nucleotide Nicotiana rustica Method 2 (see details)
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>20624 see NCBI Nucleotide Populus deltoides Method 2 (see details)
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>166236 see NCBI Nucleotide Astragalus adsurgens Method 1 (see details)
ATCGTTGCCCAATGCCTATTGCAGTGCAATAGGAATTTCTAGGGCGAATGATGGCTTCCCGTGAGCGTTGTTGCCTYGCGGTTGGTTGAAAATCGAGTCCTTGGTAGGGTGTGCCATGATAGATGGTGGTCGAGTTAGAACGATACCGATCATGTGCATGCTCCCCAAAATATGGCCTCTATGACCCACACGCGTCTTTTGACGCTCA
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>16000 see NCBI Nucleotide Alnus incana Method 3 (see details)
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>20404 see NCBI Nucleotide Ostrya virginiana Method 3 (see details)
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>18451 see NCBI Nucleotide Fragaria x ananassa Method 3 (see details)
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>18866 see NCBI Nucleotide Hordeum vulgare Method 3 (see details)
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>21638 see NCBI Nucleotide Triticum aestivum Method 3 (see details)
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>21222 see NCBI Nucleotide Secale montanum Method 3 (see details)
CGCTCCCACACCCCTCATTGGGAATCGGGATGCGGCATCTGGTCCCTCGTCTCGCAAGGGGCGGTGGACCGAAGTTCGGGCTGCCGGCGTACCGTGTCAAACACAGCGCGTGGTGGGCGTCTTTGCTTTATCAACGCAGTGCATACGACGCGTAGCCGGCATGATGGCCTCAAAACGACCCAACAAACGTAGCGCACGTCGCTTCGA
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>17923 see NCBI Nucleotide Betula pendula Method 3 (see details)
TTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCGTGCGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTTGTGTCGCGCTAGCGAAGC
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>15962 see NCBI Nucleotide Alnus viridis subsp. crispa Method 3 (see details)
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>17719 see NCBI Nucleotide Betula glandulosa Method 3 (see details)
TTGCCCCCAACCCCATCTCCTTGCAAAGGGACGAGGGGGCCTGTGGGGCAGAAATTGGCCTCCCGTGAGCTCATGCATGCGGTTGGCCTAAAAGCGAGTCCTCGGCGACGCGCGCCACGACAATCGGTGGTTGTCAAACCCTCGTGTCCCGTCGTGCGTGCGCGTCGCTCATCGTGTGCTCCTTGACCCTGCTGTGTCGCGCTAGCGACGC
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>17694 see NCBI Nucleotide Betula alleghaniensis Method 3 (see details)
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>21968 see NCBI Nucleotide Aegilops speltoides Method 3 (see details)
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>16001 see NCBI Nucleotide Avena longiglumis Method 3 (see details)
CGCTCCCAACCCCTTACGGGGGAACAGGATGCGGCATTTGGCTCCCCGTCACCCAAGGGCGGTGGGCCGAAGATATGGCTGCCGGCGCATCGTGTCGGACACAGCGCGTGGTGAGCGTCCTCGCTATACTTACCGCAGTGTCTCCGACACGTAGCCGGCGTGATGGCCTAGAATGACCCTTGTAACGGTGCGCATGACGCTCCG
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>16025 see NCBI Nucleotide Alnus maritima Method 3 (see details)
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>16131 see NCBI Nucleotide Arabidopsis thaliana Method 1 (see details)
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>16472 see NCBI Nucleotide Arabidopsis thaliana Method 1 (see details)
ACAAATCGTCGTCCCTCACCATCCTTTGCTGATGCGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGTTGGCCTAAATCCGAGCCAAGGACGCCTGGAGCGTACCGACATGCGGTGGTGAACTTGATCCATTACATTTTATCGGTCGCTCTTGTCCGGAAGCTGTAGATGACCCAAAGTCCATATAGCGA
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>21157 see NCBI Nucleotide Sinapis alba Method 1 (see details)
ACAAATCGTCGTCCCCCCATCCTCTCGAGGATATGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGCTAAGGACGTTTTGGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGAATTGTAACCTCGTCATATTGTCGGTCGTTCCGGTTCAAAAGCTCTTGATGACCCAAAGTCCTCAACGCGA
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>21158 see NCBI Nucleotide Sinapis alba Method 1 (see details)
ACAAATCGTCGTCCCCCCATCCTCTCGAGGATATGGGACGGAAGCTGGTCTCCCGTGTGTTACCGCACGCGGTTGGCCAAAATCCGAGCTAAGGACGTTTTGGAGCGTCTCGACATGCGGTGGTGAATTGTAACCTCGTCATATTGTCGGTCGTTCCGGTTCAAAAGCTCTTGATGACCCAAAGTCCTCAACGCGA
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>22033 see NCBI Nucleotide Vicia faba Method 1 (see details)
ACATATCGAAGCCTCCTTGCCAATTTCCCTGATTATTGTGCAGGGTGGATGTTGGCCTCCCGTGAGCTCTTTCGTCTCATGGTTGGTTGAAAATTGAGACCTTGGTAGGGTGTGCCATGATAGATGGTGGTTGTGTGACCCACGAGACCAATCATGCGCTGCTCTATTGAATTTGGCCTCCTTTACCCATATGCGTTTCCAAACGCTCGTGATGAGA
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>22071 see NCBI Nucleotide Vigna radiata var. radiata Method 1 (see details)
ACACATCGTCATCCCCATGCAAAAGCGCATCGGGCGAAAGGTGGCCTCCCGCGACACACCCGTCGTGGTTGGTCGAAAACCAAGGTAACGTCGGGGTCCCCCCCGCCAGAAACGGTGGATGAGCAACGCTCGAGACCAACAACGGCGGCGGCGGACACCCGGCAATCCAATCGATCGACCCTATCGCGTTCCTTGCATAATAAACAGGCAAAGACGCTCTTAACGA
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Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

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