Koetschan et al. (2010) NAR 38:D275-9
Selig et al. (2008) NAR 36:D377-380.
Schultz et al. (2006) NAR 34:W704-7.
Select a database version:
 
     
Browse
 		   
Predict
 		   
Model
 		   
Annotate
 		   
Motif
 		   
Tools
 		 
About
Flowchart
What's new
Citation
Cited by > 150
Press releases
Statistics
Updates
Supplements
Links
ITS2 in PubMed
ITS2 highlights
Staff
Funding
Acknowledgements
ITS2 group
publications
ITS2 of the month
Awards
Usage policy
Fun



ITS2 3D structure
(Keller et al. 2010)

Chlorophyta hypertree
(Buchheim et al. 2011)
Fig1, Fig2, Fig3, Fig4

Search results (11 hits, page 1)

Show entries per page

Lineage of Clavulina cristata: root; cellular organisms; Eukaryota; Fungi/Metazoa group; Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes incertae sedis; Cantharellales; Clavulinaceae; Clavulina; Clavulina cristata;
Select All
>215433632 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTRCAATCTGTGTTCCACATTCAGCTTGACCTCGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..................
>215433643 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTGCAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTGACCTCGA
..........(((((((..((.(((.((...)...)))).)))).))))).(.(.((.(...((((((((.......)))))))).).))..).)......(((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..))...))).))))).......((.(((...).)).))..................................................
>61657558 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGYTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGC
..........(((((((...(.((((.(...)...)))).)))).)))).(..(((.(...((((((((.......)))))))).).))..)).......(((((....(((((.((.(.((.((...(((((((((((....))).)..))))))))))))))..))...))).))))).......(((.....))).............................................
>215433622 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GYGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGGTTGCTTCTAAACCCGGTTTTGCAGATTGTTTTGATCTGTATTCCAATTTCAGCTTGACCTCGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.(((......(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))...))))))))).))).........((...((((((.(.(...))))))))..))...................
>215433635 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCCTAACCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTGCCTTCATTGGAACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTCGTGGCAACTGGTTCTACTCAGCGTGATAATAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTGCAGATTCTTCAATCTGTGTTCCACTTTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...))))))..)))).))))).....))).))))).((.(((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..)))))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((..((((((.(.....)))))))..))).............
>215433639 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGYTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTTGA
(((((..((((((((.(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..............
>215433644 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCTTGACCTGAG
(((((..((((((((.(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))...................
>61657549 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 2 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGYTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCACATTTCAGCT
(((((..((((((((.(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))..........
>147742855 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 3 (see details)
GTGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGCTTTTTGTCTGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTTGTTGGGACGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTGNCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGTTTTGCAGATTCTTGAATCTGTGTTCCA
(((((..((((((((.((((((((..(...).)))).).))).))))).....))).))))).(((.(...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).).))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))
>194304253 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 3 (see details)
CNAAATTTCTCAAGCTTGGATGACATTTTTTGTCTGTCCTTAGTTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCCCTTCATTGGGATGGCTGGCCTTAAAAGCATTAGCTGATCCTTGTGTTGAACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGTCCCCATTTGGGTTGCTTCTAAACCTGGTTTTGCAGATTATTTTGATCTGTGTTCC
(.((..((((((((((.(((((.....(...)..)))).).))))))).....))).)).)..((...(....(((.(((.((((((((..(...)))..)))))).)))..)))..).)).(((...((((((.(((......(.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))...))))))))).))).........((...((((((.(......)))))))..))
>31745598 see NCBI Nucleotide Clavulina cristata Method 3 (see details)
GCGAAATTTCTCAAGCTTGGATGGATTTTTTGTCCGTCCTTAGCCTTGGTTGTTGGGCTTTGCCGTGTCCTTCATTGGTACGGCTGGCCTTAAAAGCATCAGCTGATCCTCGTGTGGCACTGGTTCTACTCAGCGTGATAACAGTCTGATCGCTGAGGACATCTTTTGGGATGGCCAGCTCTCATTTGGGTTGCTTCTAAACTTGGCTTCACAGATTGTACAATCTGTGTTCCA
(((((..((((((((.(((((((((..(...)))))).).))).))))).....))).))))).(((((...(((.((.(((((((((..(...)))..)))))).)))..))).))))).(((...((((((.((((....((.(((.(((((.((((....)))).)).))).))))).)))))))))).)))........(((...((((((.(.....)))))))..)))
Select All

Show entries per page

Used methods

Id Description*
1 Unafold - Direct
2 Homology modeled
3 Partial structure
*These structures have been modeled as accurately as possible, but represent only template based predictions and thus may be not as accurate as experimentally verified RNA structures

If you use the database please cite.